Para que os alunos possam aplicar os conhecimentos aprendidos em sala de aula e compreender suas interfaces, o Colégio Loyola proporciona uma infra-estrutura de laboratórios de Física, Química, Biologia, Ciências e Informática. 

Cada laboratório fica sob a responsabilidade de um profissional técnico e é usado para aulas ministradas por professores especializados em práticas laboratoriais.

Todo esse cuidado reflete a importância que o Colégio dá à experimentação científica de seus alunos, desde a mais tenra idade.

Os objetivos são incentivar a curiosidade, a partilha, o trabalho em grupo, e levar os alunos a experimentar, descobrir e concluir.